Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NfyaP23708 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfyaP23708 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms