Protein–RNA interactions for Protein: P17950

Ier2, Immediate early response gene 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier2P17950 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ier2P17950 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms