Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd2P13011 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd2P13011 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd2P13011 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms