Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms