Protein–RNA interactions for Protein: P10922

H1f0, Histone H1.0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1f0P10922 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H1f0P10922 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H1f0P10922 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H1f0P10922 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms