Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd4P10628 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms