Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CatspereP0DP43 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CatspereP0DP43 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CatspereP0DP43 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms