Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms