Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01798 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01798 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01798 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01798 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01798 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01798 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01798 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01798 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01798 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01798 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01798 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms