Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms