Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amy1P00687 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amy1P00687 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms