Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda1O88958 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms