Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JtbO88824 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JtbO88824 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JtbO88824 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JtbO88824 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JtbO88824 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JtbO88824 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JtbO88824 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JtbO88824 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JtbO88824 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JtbO88824 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms