Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops6O88545 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops6O88545 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops6O88545 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops6O88545 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms