Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Foxq1O70220 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxq1O70220 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms