Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr1O55100 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms