Protein–RNA interactions for Protein: O55087

Mef2b, Myocyte-specific enhancer factor 2B, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mef2bO55087 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mef2bO55087 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms