Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncaO55042 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncaO55042 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncaO55042 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncaO55042 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms