Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc1a6O35544 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms