Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms