Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppef2O35385 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ppef2O35385 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppef2O35385 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms