Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abcc1O35379 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms