Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dgcr6O35347 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Dgcr6O35347 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Dgcr6O35347 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dgcr6O35347 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms