Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Nedd9O35177 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Nedd9O35177 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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