Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MttpO08601 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MttpO08601 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MttpO08601 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MttpO08601 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MttpO08601 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MttpO08601 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MttpO08601 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MttpO08601 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MttpO08601 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MttpO08601 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MttpO08601 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MttpO08601 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms