Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms