Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r80L7N1Z3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r80L7N1Z3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms