Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21797J3QNW5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms