Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ccdc180J3QNE4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms