Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm6594J3QM43 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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