Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms