Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip12G5E870 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip12G5E870 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms