Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms