Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NpcdF8VQB8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms