Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BicraF8VPZ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
BicraF8VPZ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms