Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28048F7BCN0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28048F7BCN0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28048F7BCN0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm28048F7BCN0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms