Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms