Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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