Protein–RNA interactions for Protein: F6QKH6

Lipo5, Lipase, member O5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo5F6QKH6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lipo5F6QKH6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lipo5F6QKH6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms