Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Urb2E9Q7L1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Urb2E9Q7L1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Urb2E9Q7L1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms