Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BC005561E9Q5E2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BC005561E9Q5E2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms