Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DspE9Q557 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DspE9Q557 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms