Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp1E9Q368 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp1E9Q368 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms