Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3095E9Q058 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3095E9Q058 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3095E9Q058 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3095E9Q058 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3095E9Q058 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm3095E9Q058 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm3095E9Q058 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3095E9Q058 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3095E9Q058 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms