Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh10E9PXQ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcdh10E9PXQ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcdh10E9PXQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms