Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim5E9PV98 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim5E9PV98 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms