Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptrhd1D3Z4S3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptrhd1D3Z4S3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms