Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12cD3Z3L3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms