Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm7849D3YX03 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm7849D3YX03 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm7849D3YX03 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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