Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Cttnbp2B9EJA2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms